Попробуй пошариться по рынкам и магазинам. Несмотря на то, что уплотнители на вид все одинаковые, при детальном ощупывании часто удаётся найти куда более толстый. Или заменить на похожий(неродной), но более объёмный. Может помочь. Возможно заменить часть уплотнителя. Убьёшь сразу 2 зайцев. 1-загерметизируешь багажник. 2-уплотнителем натянешь замок так, что он перестанет стучать. Правда возможно, что усилие закрытия увеличится.